В Журнале микробиологии применяется процесс двойного слепого рецензирования, рецензенты не знают личности авторов, а авторы также не знают личности рецензентов. Для каждой статьи в выпуске имеется как минимум один внешний рецензент для проверки работы исследователей/ученых/ученых. Обработка рецензии журнала осуществляется членами редакционной коллегии журнала одновременно с предварительным рецензированием со стороны редакции.
Каждая представленная рукопись проходит предварительную проверку качества редакцией с последующим внешним рецензированием. Обычно предварительный контроль качества завершается в течение 7 дней и в основном касается формата журнала, английского языка и объема журнала.